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Table of Contents

you.jpg


Hello,I am Cheng-Hao Hsueh.

Todo

  • integrate HELP into Swiss-ADS
  • 整理 cgi 需要檔案及README
  • 整理 ADS Help部份
  • 流程圖(reprot.cgi分開)
  • csv ads 程式
  • 整理res資料匣(加註解)
  • 分析PPI 繪圖
  • analysis頁面 圖片重抓

next

  • formatdb HPRD
  • blast -d HPRD -i sprot
  • len > 80 and idt > 25%, then these two seqs are similar
  • % of hliex residue
  • % of beta residue
  • % of coil
  • % of disorder
  • idt > 25%
  • e-value ⇐ 0.001 or idt >= 25%, then these two seqs are similar

feature

  • disorder最長?數目?
  • alpha beta coil 最長?數目?
  • 兩兩feature相乘
  • feature倒數 或 取log e
  • 帶電性 親疏水性
  • 總長度
  • 總表面積
  • 20種胺基酸數目 百分比
  • 極性 比例

other

  • sync database

Note

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